生态修复研究团队依托于山区生态系统碳循环与碳调控重庆市重点实验室，2017年成立校级研究中心，2018年获重庆市科技局批准建设重庆市重点实验室，2023年通过重庆市科技局优化重组，研究重心从长江上游湿地碳循环拓展到山区典型生态系统碳循环与碳调控。实验室已经形成了湿地、岩溶、森林等生态系统碳循环的优势方向，建成了三峡库区湿地科学野外试验站、乡村小微湿地研究中心、岩溶水库碳动态长期定位观测站等野外平台。团队现有固定人员12人，其中高级职称10人，国家级人才1人，省部级人才2人，博士11人，硕士1人。

面向国家和重庆市“碳达峰、碳中和”目标重大需求，团队成员以提升和优化人类活动干扰下生态系统碳汇功能为关键目标，围绕西南山区，特别是三峡库区湿地、岩溶、森林、草地等生态系统碳循环过程及碳汇形成机制、碳通量监测与模型模拟、增汇减排技术研发等重大科学问题，开展了大量基础和应用研究，在岩溶湿地碳循环、内陆淡水湿地碳排放与调控、森林生态系统碳库稳定性等方面取得了系列高水平成果。团队在《Water Research》、《Journal of Hydrology》、《Catena》、《Science of the Total Environment》、《中国科学·地球科学》、《生态学报》等国内外高水平期刊发表论文200余篇，在国际以及国内形成了一定的影响力，是西南地区重要的科技力量。未来，团队将致力于打造“山区陆地生态系统碳汇监测与收支核算系统平台”，突破制约山区陆地碳汇效应准确评估的关键问题，为制定符合山区生态系统特征的“碳增汇”自然方案提供科技支撑。

代表性成果：

（1）三峡库区消落带湿地生态系统服务功能优化及碳减排关键技术研究

三峡水库蓄水运行形成了面积广大的消落带，消落带湿地生态系统结构与功能退化严重威胁库区生态安全，优化消落带生态服务功能从而成为三峡水库可持续发展的重要基础。王晓锋研究团队围绕三峡库区消落带生态系统演变及调控机制这一关键科学问题开展研究，依托长期定位观测，构建了三峡库区消落带适生植物资源库、生物群落演变动态数据库，从植物-土壤演变关系中揭示了消落带生态系统演化的长期规律。构建了消落带-水域温室气体排放动态监测数据库，评估了三峡水库温室气体释放效率、动态及影响因素，开创性的提出了适应库区水位波动的基塘工程技术体系、林泽碳汇工程技术体系、复合型消落带碳排放削减技术体系，建立了超过15 km²的工程示范区。针对城镇消落带景观优化，提出了景观基塘工程技术、水上林泽景观营造技术，形成了一套库岸生态系统整体设计理论，投资1.7亿元在开州区汉丰湖进行了工程示范建设。成果获重庆市科技进步一等奖，并为梁平区获批国际湿地城市、汉丰湖获批国家级湿地公园、湖北朱湖获批国家湿地公园等提供了技术支持，社会经济效益超6亿元。此外，研究成果还被四川、贵州、湖北、山东等采纳，实施合计超过20亿元的生态建设项目。

（2）岩溶碳汇形成机制及重庆市岩溶生态系统碳汇特征

“岩溶碳汇”被列入国家“碳达峰、碳中和”行动方案，提升、优化和稳定岩溶碳汇成为国家实现“碳中和”目标的重要路径。在地球系统科学思想指导下，蒲俊兵研究团队围绕岩溶碳汇机制、碳汇评价与优化调控等关键科学问题，在岩溶碳汇形成机制方面取得了系列成果。研究发现中国西南岩溶区河流生态系统中碳酸盐缓冲效应与水生光合生物碳泵效应的协同作用促进了岩溶碳汇生成与稳定发展；发现了岩溶区水库可直接吸收大气CO₂形成显著碳汇效应，并揭示了“闭锁”水体内部CO₂扩散、迁移的机制，为岩溶碳汇形成和稳定提供了新途径。团队较为系统地评价了重庆岩溶生态系统碳储量现状、碳汇能力及潜力，发现重庆岩溶生态系统固碳总量年均2133万吨，地上碳储量为7.09亿吨；重庆武陵山生态屏障区、三峡库区核心区生态涵养区、大巴山生态屏障区碳汇现状储量大，而丘陵谷地生态品质提升区、大娄山生态屏障区增汇潜力大。相关成果发表在国内外学科领域前沿学术期刊，部分成果多次被中国应对气候变化的政策与行动年度报告（IPCC）（2019，2022，2023）采用。

（3）山区城市河网系统碳排放及其流域控制

河流是连接陆地与海洋两大碳库的关键通道，同时也会向大气排放CO₂和CH₄等温室气体。随着全球城市化的不断推进，大量人为碳氮输入河流，造成河流碳排放的增强。团队通过对重庆主城区河网系统的高空间分辨率的监测分析，确定了城市化过程导致河流水体CO₂和CH₄排放显著增强，城市河流是温室气体排放的热源；揭示了陆域城市化强度与河流水体碳排放的模型关系，构建了基于土地利用类型变化以及水质参数的大都市区河网系统碳排放预测模型；特别是发现不同城市化强度下河流CO₂与CH₄排放调控机制存在差异，强调构建不同人为干扰下的河流碳排放动态模式。相关研究发表在Journal of Hydrology、Journal of Geophysical Research、Science of Total Environment、环境科学的国内外期刊，同时被IPCC第六次评估报告引用。